研究生教育研究中心以管委会为管理决策机构，下设秘书处，秘书处由办公室、学术部、融媒体部三个内设机构组成，服务与管理中心的日常工作。
1. 办公室：重点开展中心相关综合性工作，主要包括规划制定、财务报告、研究课题、学术交流等相关工作，努力发挥综合协同及服务保障作用。
2．学术部：重点开展研究生教育研究工作，主要包括委托课题研究、国内外研究生教育动态追踪、学校研究生教育政策分析等相关工作，努力发挥研究生教育创新管理智库及政策咨询作用。
3．融媒体部：重点开展中心及研究生教育相关宣传工作，主要包括运营浙江大学研究生教育公众号、交流采访等相关工作，努力传播浙大经验与实践提供畅通有效的新媒体平台。
